345

2022

Европейское региональное бюро ВОЗ / Европейский центр профилактики и контроля заболеваний

Regional Office for Europe / European Centre for Disease Prevention and Control

17

За последний год появилось несколько вариантов COVID-19, вызывающих обеспокоенность, и мониторинг их циркуляции во всех странах является ключевой задачей. Полногеномное секвенирование или как минимум полное или частичное секвенирование гена S – это наилучший метод описания конкретного варианта. Для раннего выявления и расчёта распространенности вариантов, вызывающих обеспокоенность, вариантов, вызывающих интерес, и вариантов, требующих дальнейшего мониторинга, разработаны и другие методы, в т.ч. тест-системы для диагностического скрининга на основе методов амплификации нуклеиновых кислот (МАНК). Многие из этих методов позволяют точно идентифицировать указанные варианты, а остальные требуют подтверждения как минимум некоторого подмножества образцов путём полного или частичного секвенирования гена S.

Генетический мониторинг следует включить в общие стратегии надзора за вирусами, вызывающими респираторные заболевания. К конкретным задачам выявления и идентификации вариантов относится оценка циркуляции различных вариантов SARS-CoV-2 среди местного населения путем отбора репрезентативных выборок для секвенирования, определение генетических характеристик для мониторинга эволюции вируса и формирование доказательной базы для принятия решений о составе вакцин или анализа вспышек. При использовании тест-систем на основе МАНК необходимо провести подтверждающее секвенирование как минимум некоторого подмножества вирусов, чтобы эти результаты анализа можно было использовать как показатели циркуляции вариантов вируса, в частности ВВО, среди населения. Перед внедрением нового метода тестирования или новой тест-системы необходимо провести валидацию и проверку, чтобы подтвердить, что лабораторная тест-система способна надёжно выявлять циркулирующие вирусы.

Настоящий документ был разработан техническими экспертами ECDC и Европейского регионального бюро ВОЗ, а его предыдущие версии прошли рецензирование экспертами специализированных лабораторий ВОЗ и Рабочей группы по характеризации SARS-CoV-2.

438